Rune Micha Pedersen

Læge og Ph.d. studerende:  Rune Micha Pedersen  (Start 01.03.15)  

Tilknytning: Forskningsenheden for Klinisk Mikrobiologi

Hovedvejleder: Professor, forskningsleder, dr.med. Hans Jørn Kolmos

Medvejleder: Seniorforsker, Ph.d. Thomas-Emil Andersen

Shigatoksin producerende Eschericia coli: Dannelse af biofilm, cellulær destruktion og aktivering af komplement, et in-vitro studie

Shigatoksin producerende  Eschericia coli (STEC) er en fødevarebåren bakterie som er i stand til at forårsage blodig diarré samt organsvigt som en del af det hæmolytisk uræmiske syndrom (HUS). Bakteriens udbrudspotentiale er berygtet, hvilket giver udfordringer inden for både samfundsøkonomi, fødevaresikkerhed og sundhedssektoren. Børn er særligt udsatte for alvorlige komplikationer og til trods for, at bakterien har været kendt siden 1980´erne, så findes der forsat ingen aktiv behandling. Dette er relateret til manglende viden om STECs basale patogenese mekanismer.  Ved hjælp af unikke biofilm- og cellemodeller, som er udviklet på KMA, OUH, kombineret med immunologiske metoder, undersøges STECs evne til at danne biofilm og afgøre om dette påvirker dens virulens. Vi kvantificerer og visualiserer bakteriens evne til at nedbryde et tarmepithel cellelag og undersøger bakteriens evne til at aktivere komplimentsystemet. Dette grundvidenskabelige projekt vil forhåbentlig belyse dele af den basale patogenese og afdække mulige lægemiddel targets.

Metode:

1. Bakteriens evne til at kolonisere abiotiske overflader kvantificeres ved kolonitælling fra biofilm og visualiseres med konfokal lasermikroskopi.
2. Bakteriens evne til at destruere cellelag undersøges med modstandsmåling over inficerede cellelag og visualiseres med fluorescens mikroskopi
3. Bakteriens evne til at aktivere komplement systemet undersøges med Sandwich ELISA på fuldblod udsat for bakteriel påvirkning.

Perspektiv:

1. Bedre forståelse af basale sygdomsmekanismer.
2. Afsøgning af mulige lægemiddeltargets.
3. Bedre diagnostisk karakterisering af STEC isolater.
4. Muligt potentiale inden for fødevareindustrien.