Der er flere modeller for udnyttelse af samejede opfindelser.
Forud for et forskningssamarbejde fastlægges parternes rettigheder til resultaterne af forskningen i en aftale. Aftalen bør også tage stilling til hvem, der har udnyttelsesretten til samejede immaterielle rettigheder.
Opstår et sameje som et resultat af et forskningssamarbejde med en virksomhed, deles udnyttelsesretten ofte således, at virksomheden har retten til at udnytte opfindelsen inden for sit afgrænsede produkt- eller forretningsområde, og universitetet har retten uden for området.