Instituttets forskning er organiseret i otte forskningsenheder:
Exercise Epidemiology (ExE)
Fysisk Aktivitet og Sundhed i arbejdslivet (FAS)
Klinisk Biomekanik (KB)
Muskelfysiologi og Biomekanik (MoB)
Muskuloskeletal Funktion og Fysioterapi (FoF)
Active Living (AL)
Bevægelse, Kultur og Samfund (BKS)
Idrætspædagogik og Sportspsykologi (IPSP)
Fra januar 2013 er den forskningsenhed der tidligere var kendt som: Bevægelse, Idræt og Samfund (BIS) ændret således at de tre nye enheder AL, BKS og IPSP er opstået. Formålet hermed er at tilpasse organisationen sådan, at forskningen inden for de humanistiske og samfundsvidenskabelige aspekter af Idræt har de bedst mulige rammer. Medarbejdere fra BIS er overflyttet til de nye forskningsenheder.