BMBs Center for Experimental Bioinformatics (CEBI), der blandt andet forsker i proteiner og hvordan de fordeler sig i cellen og medvirker til cellesignalering og stamcellers udvikling, har netop færdiggjort en stor undersøgelse af "fosforyleringssites" på proteiner fra cellekernen. Arbejdet er publiceret i det internationalt anerkendte tidsskrift Molecular & Cellular Proteomics (MCP).
Under titlen "Site-specific phosphorylation dynamics of the nuclear proteome during the DNA damage response" gennemfører CEBI netop nu et projekt sammen med Kræftens Bekæmpelse, der belyser, hvorledes celler reagerer på meget alvorlige DNA-skader - eksempelvis som følge af Røntgenstråling. I projektet er profiler, der viser regulering over tid for mere end 5000 "fosforyleringssites" på proteiner fra cellekernen, blevet bestemt. Dette gør denne videnskabelige undersøgelse meget vigtig for en dybere forståelse af, hvorledes cellen responderer overfor stråling, der kan forårsage fatale DNA skader, over tid. Vigtigheden og nyhedsværdien i undersøgelse er cementeret ved, at artiklen lige efter udgivelsen i marts var den næst mest læste artikel på MCPs hjemmeside.
Ny erkendelse
- Traditionelt har forskningen inden for DNA-skade respons været fokuseret omkring fosforylering som mediering af signalering i cellen. I dette projekt har vi vist, at defosforylering i langt højere grad end antaget er involveret i selv den helt tidlige signalering, forklarer Martin V. Bennetzen (billedet), der til dagligt er 4+4 PhD-studerende ved CEBI med Jens Andersen som vejleder og som i januar 2010 modtog Videnskabsministeriets EliteForsk Rejsestipendium for Ph.D. studerende.
I projektet er det endvidere vist, at fosforyleringsbaseret signalering regulerer proteiner, der er i stand til at modificere andre proteiner ved f.eks. acetylering og methylering. Derudover er det vist, at proteiner involveret i modifikation af RNA ligeledes er reguleret fosforylering. Således er det hypotesen, at tidlig fosforyleringsafhængig signalering konverteres til signalering baseret på andre typer af modifikationer af proteiner og RNA.
Martin V. Bennetzen og Jens Andersen har begge redegjort for deres arbejde med projektet som talere i forbindelse med den internationale konference "ECDO - Euroconference on Apoptosis" i Paris i september 2009.
Læs artiklen i MCP
Nyhed fra NAT. Lagt på af U. Aljene.
10.05.2010
Tilbage til nyhedsoversigten