Ledelsessekretariatet ledes af sekretariatschef Merete Ruager.
Ledelsessekretariatet varetager opgaver i forbindelse med den overordnede politiske og administrative ledelse af universitetet, herunder:
- Sekretariatsfunktioner for rektor, universitetsdirektør, direktionsmøder, bestyrelse, Repræsentantskab samt en række udvalg og fonde.
- Sagsbehandling i forbindelse med fastlæggelse af universitetets overordnede uddannelses- og forskningspolitik samt planlægning af universitetets strategiske satsningsområder, herunder i forbindelse med udarbejdelse af udviklingskontrakten.
- Sekretariatets juridiske kontor yder bistand vedrørende universitetslov og andre universitetsjuridiske forhold. Juridisk kontor forhandler og udarbejder samarbejdsaftaler og kontrakter samt foretager legalisering heraf. Endvidere foretages sagsbehandling af rektoratets klage- og ankesager i forbindelse med universitetsdirektørens legalitetskontrol.
- Ledelsessekretariatet er ansvarlig for universitetets repræsentative forpligtelser.
- Teknologioverførsel, der varetager patentering og kommercialisering af universitetets og Region Syddanmarks opfindelser. Endvidere foretages vurdering af opfindelser og markedsforhold til brug for fastlæggelse af modeller til kommercialisering.